Test der anvendes ved infektion med Coronavirus 2019-nCoV / SARS-CoV-2
Beslægtet med SARS-CoV og MERS-CoV
Synonymer
Coronatest; PCR-test for corona; Coronavirus-test; Corona-PCR-test
Indikationer
Mistanke om smitte/infektion med SARS-CoV-2 eller COVID-19 sygdom
Testen bruges også til udelukkelse af aktiv infektion fx før planlagt behandling på hospital, rejser til nogle lande/udstedelse af ”COVID pas”, ved opsporing af sygdom hos nære kontakter mv.
Fortolkninger
Prøven er positiv / SARS-CoV-2 påvist
Hvis prøvesvaret er "Positiv" / "Påvist" hos en person, der ikke tidligere har haft COVID-19 sygdom, betyder det, at personen er smittet med aktivt COVID-19
Testen kan være positiv flere uger efter en COVID-19 infektion, også hos immunkompetente personer
Prøven er negativ = SARS-CoV-2 IKKE påvist
Hvis prøvesvar er "Negativ" / "Ikke påvist" betyder det, at personen ikke er smittet med aktivt COVID-19 virus
Prøven er "Inkonklusiv" eller "Ubedømmelig" = SARS-CoV-2 analysen har ikke kunnet gennemføres
Hvis prøvesvar er "Inkonklusiv"/"Ubedømmelig"/"Mislykket" betyder det, at patientens virustest ikke har vist et klart svar. Der bør tages en ny prøve
Må ikke forveksles med svagt positiv og skyldes ofte, at analysemetoden ikke har kunnet fungere
Fejlkilder (og kilder til normal variation)
Prøven er taget så tidligt/sent i forløbet, at virusmængden er under detektionsgrænsen for analysen (se figur på link sidst i artiklen)
Coronavirus-infektion: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) giver Coronavirus disease 2019 (COVID-19)
Coronavirus inficerer både dyr og mennesker, hvor de i varierende omfang forårsager sygdom
En betydelig del af person-til-person transmission af SARS-CoV-2 virus kan ske, før den inficerede selv udvikler symptomer (præsymptomatisk transmission)3
En lille del af dem, der er inficeret med SARS-CoV-2, udvikler aldrig symptomer, men kan stadig smitte andre og dermed bidrage til spredning af sygdommen4
Forekomsten af asymptomatiske tilfælde kan variere i forskellige aldersgrupper og afhængigt af smittespredningen i samfundet
Bruges til diagnostik af aktiv SARS-CoV-2 infektion ved detektion af virus RNA og bruges oftest efter udvikling af symptomer, men kan også bruges til præsymptomatisk screening5
Indtil videre er NAT/NAAT de mest anvendte og de mest pålidelige test til diagnostik af COVID-19 sygdom
Kinetikken i udviklingen af virusmængde, og dermed følsomheden af testen hos personer uden symptomer, er endnu ikke så godt kendt
Prøvetagning
Svælgpodning er den hyppigste prøveform
Skyllevæske fra næsesvælg-rum. Kan anvendes ved børn
Mange test for SARS-CoV-2 virus RNA undersøger også for tilstedeværelse af humant RNA/DNA i prøven. Hvis der ikke kan påvises humant materiale i testen, anses prøvetagning for ikke korrekt
De to hyppigste kilder til forkerte/falsk negative resultater er fejlagtig prøvetagning og forkert timing af prøvetagning i forhold til symptomdebut, se link til figur sidst i artiklen
Egentlige laboratoriefejl er temmelig sjældne
Referenceintervaller
SARS-CoV-2 DNA/RNA
Hos raske bør der være fravær af virus = negativ / ikke påvist
NPU
NPU59105
NPU59178
Analysetest
Nucleic acid tests (NATs) / nucleic acid amplification tests (NAATs) bruges til diagnostik af aktiv SARS-CoV-2 infektion ved detektion af virus RNA
Bruges oftest efter udvikling af symptomer, men kan også bruges til præsymptomatisk eller asymptomatisk screening 5
Man skal dog være opmærksom på kinetikken af virus under infektionen, se figuren på link sidst i artiklen
Testene er rettet mod og måler et eller flere virale RNA. Sammensætningen af mål RNA er afhængigt af testproducenten. De hyppigste mål RNA er:
Envelope (env)
Nucleocapsid (N)
Spike protein (S)
RNA-dependent RNA
Polymerase (RdRp)
ORF1-gen
Disse assays følsomhed for virus er meget ens, undtaget de assays, der benytter RdRp-SARSr (Charité) proben, som giver lavere følsomhed
Der udføres overordnet tre typer test i Danmark
Patientnære test (POCT). Disse udføres på små PCR/PCR-lignende apparater, der fx står i akutmodtagelser. Der udføres en test ad gangen, svartiden er 1-2 timer
Test udført på klinisk mikrobiologiske afdelinger på større automatiserede PCR-udstyr. Svartiden er 4-8 timer
Test udført på store eksterne laboratorier på større automatiserede PCR-udstyr. Svartiden er typisk 12-24 timer
De fleste NAT/NAAT udføres på PCR maskiner, og disse test er semikvantitative
Ved at få oplyst Ct/Cq værdierne kan man få et semikvantitativt indtryk af viral load. Dette kan sammen med klinikken bruges til at fastlægge, hvor i infektionsforløbet en patient er
Viralload har betydning for, i hvilket omfang patienten smitter, skal isoleres mv. Denne vurdering skal ske i samråd med en mikrobiolog eller infektionsmediciner
Sammenhæng mellem SARS-CoV-2 test og virusmængde og positiv test
Skematisk fremstilling af sandsynligheden for, hvornår de forskellige diagnostiske tests er positive i løbet af en SARS-CoV-2 infektion i forhold til fremkomsten af symptomer. Link til figur
Kilder
Referencer
Weissleder R, Lee H, Ko J, Pittet MJ. COVID-19 diagnostics in context. Sci Transl Med. 2020; 12..
PubMed
Sethuraman N, Jeremiah SS, Ryo A. Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2. JAMA. 2020..
PubMed
He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, Lau YC, Wong JY, Guan Y, Tan X, Mo X, Chen Y, Liao B, Chen W, Hu F, Zhang Q, Zhong M, Wu Y, Zhao L, Zhang F, Cowling BJ, Li F, Leung GM. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med. 2020; 26.; 672-675.
PubMed
Li R, Pei S, Chen B, Song Y, Zhang T, Yang W, Shaman J. Substantial undocumented infection facilitates the rapid dissemination of novel coronavirus (SARS-CoV-2). Science. 2020; 368.; 489-493.
PubMed
Lippi G, Mattiuzzi C, Bovo C, Plebani M. Current laboratory diagnostics of coronavirus disease 2019 (COVID-19). Acta Biomed. 2020; 91.; 137-145.
PubMed
Fagmedarbejdere
Nete Hornung
Cheflæge, Klinisk biokemisk afdeling, Hospitalsenheden Vest
Dorte Bojer
Alm. prakt. læge, Grenå
Har du en kommentar til artiklen?
Bemærk venligst, at du IKKE vil modtage svar på henvendelser, der omhandler din egen sygdom, pårørendes sygdom, blodprøvesvar, hjælp til at udarbejde skoleopgaver og litteratursøgning.
