Lægehåndbogen

PCR-test, SARS-CoV-2 DNA/RNA, COVID-19

Lennart Friis-Hansen

speciallæge

Definition

  • Test der anvendes ved Infektion med Coronavirus 2019-nCoV / SARS-CoV-2
  • Beslægtet med SARS-CoV og Mers-CoV

Baggrund1,2

  • coronavirus-infektion: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) giver Coronavirus disease 2019 (COVID-19)
    • Coronavirus inficerer både dyr og mennesker, hvor de i varierede omfang forårsager sygdom
    • En betydelig del af person-til-person transmission af SARS-CoV-2 virus kan ske før den inficerede selv udvikler symptomer (præsymptomatisk transmission)3
    • En lille del af dem, der er inficeret med SARS-CoV-2, udvikler aldrig symptomer, men kan stadig smitte andre og dermed bidrage til spredning af sygdommen4
    • Forekomsten af asymptomatiske tilfælde kan variere i forskellige aldersgrupper og afhængigt af smittespredningen i samfundet
  • Nucleic acid tests (NATs) / nucleic acid amplification tests (NAATs)
    • Bruges til diagnostik af aktiv SARS-CoV-2 infektion ved detektion af virus RNA og bruges oftest efter udvikling af symptomer, men kan også bruges til præsymptomatisk screening5
    • Indtil videre er NAT/NAAT de mest anvendte og de mest pålidelige test til diagnostik af COVID-19 sygdom
    • Kinetikken i udviklingen af virusmængde og dermed følsomheden af testen hos personer uden symptomer er endnu ikke så godt kendt

Bemærk:

  • Artiklen omtaler IKKE test for antistoffer for COVID-19
  • Artiklen omtaler IKKE de test og prøver, du evt. selv kan købe på apoteker og andre steder

NPU

  • NPU59105
  • NPU59178

Referenceintervaller

SARS-CoV-2 DNA/RNA

  • Hos raske bør der være fravær af virus = negativ / ikke påvist

Indikationer

  • Mistanke om smitte/infektion med SARS-CoV-2 eller COVID-19 sygdom
  • Testen bruges også til udelukkelse af aktiv infektion fx før planlagt behandling på hospital, rejser til nogle lande/udstedelse af ”COVID pas”, ved opsporing af sygdom hos nære kontakter mv. 

Prøvetagning

  • Svælgpodning er den hyppigste prøveform 
  • Det er meget vigtigt at prøverne tages korrekt, se fx denne video om prøvetagning
  • (Det er vigtigt, at sundhedspersonalet bruger de korrekte værnemidler og tager de korrekte forholdsregler i forbindelse med aerosol-genererende procedurer)
  • Mange test for SARS-CoV-2 virus RNA undersøger også for humant RNA/DNA. Hvis der ikke kan påvises humant materiale i testen anses prøvetagning for ikke korrekt
  • De to hyppigste kilder til forkerte/falsk negative resultater er fejlagtig prøvetagning og forkert timing af prøvetagning i forhold til symptomdebut, se figur på link sidst i artiklen.
  • Egentlige laboratoriefejl temmelig sjældne

Analysetest

  • Nucleic acid tests (NATs) / nucleic acid amplification tests (NAATs) bruges til diagnostik af aktiv SARS-CoV-2 infektion ved detektion af virus RNA
    • Bruges oftest efter udvikling af symptomer, men kan også bruges til præsymptomatisk eller asymptomtisk screening 5
    • Man skal dog være opmærksom på kinetikken af virus under infektionen, se figuren på link sidst i artiklen
  • Testene er rettet mod og måler et eller flere virale RNA. Sammensætningen af mål RNA er afhængigt af test-producenten. De hyppigste mål RNA er:
    • Envelope (env)
    • Nucleocapsid (N)
    • Spike protein (S)
    • RNA-dependent RNA
    • polymerase (RdRp)
    • ORF1 gen

Assayenes følsomhed for virus er meget ens undtaget de assays, der benytter RdRp-SARSr (Charité) proben, som giver lavere følsomhed

  • Der udføres overordnet tre typer test i Danmark
    • Patientnære test (POCT). Disse udføres på små PCR/PCR lign apparater, der fx står i akutmodtagelser. Der udføres en test af gangen, svartiden er 1-2 timer
    • Test udført på klinisk mikrobiologiske afd. på større automatiserede PCR-udstyr. Svartiden er 4-8 timer
    • Test udført på store eksterne laboratorier på større automatiserede PCR-udstyr. Svartiden er typisk 12-24 timer
  • De fleste NAT/NAAT udføres på PCR maskiner, og disse test er semikvantitative.
    • Ved at få oplyst Ct/Cq værdierne kan man få et semikvantiativt indtryk af viral load. Dette kan sammen med klinikken bruges til at fastlægge, hvor i infektionsforløbet en patient er
    • Viralload har betydning for, i hvilket omfang Pt smitter, skal isoleres mv. Denne vurdering skal ske i samråd med en mikrobiolog eller infektionsmediciner.

Sammenhæng mellem SARS-CoV-2 test og virusmængde og positiv test

Se figuren i pdf-version

Fortolkning

Prøven er positiv / SARS-CoV-2 påvist

  • Hvis prøvesvaret er "Positiv" / "Påvist" hos en person, der ikke tidligere har haft COVID-19 sygdom, betyder det, at personen er smittet med aktivt COVID-19
  • Hvis en asymptomatisk person testes positiv for SARS-CoV-2 efter netop overstået, bekræftet COVID-19 infektion, fx forud for indlæggelse, eller som følge af nær kontakt til en person med bekræftet COVID-19, bør et positivt testresultat tolkes sådan: 
    • Tidligere påvist COVID-19 < 8 uger siden: Det positive testresultat tilskrives inaktivt virus RNA
    • Tidligere påvist COVID-19 > 8 uger siden: Det kan ikke udelukkes, at det positive testresultat skyldes re-infektion med ny coronavirus (SARS-CoV-2), hvorfor personen ud fra et forsigtighedsprincip håndteres som værende smittet
  • OBS: Ved overstået COVID-19 infektion forstås, at personen, som minimum har haft ophør af symptomer i 48 timer og i denne periode har kunnet betragtes som rask ift. sin tidligere COVID-19 infektion
  • Se Sundhedsstyrelsens anbefalinger til den, der er testet positiv for coronavirus.

Prøven er negativ = SARS-CoV-2 IKKE påvist

  • Hvis prøvesvar er "Negativ" / "Ikke påvist" betyder det, at personen ikke er smittet med aktivt COVID-19 virus

Prøven er "Inkonklusiv" eller "Ubedømmelig" = SARS-CoV-2 analysen har ikke kunnet gennemføres 

  • Hvis prøvesvar er "Inkonklusiv" eller "Ubedømmelig" betyder det, at patientens virustest ikke har vist et klart svar. Der bør tages en ny prøve

Fejlkilder

  • Prøven er taget så tidligt/sent i forløbet, at virusmængden er under detektionsgrænsen for analysen (se figur på link sidst i artiklen)
  • Forkert prøvetagning, se ovenfor (se video)

Patientinformation 

Andre sundhedsfaglige artikler

Figur

Skematisk fremstilling af sandsynligheden for de forskellige diagnostiske tests er positive i løbet af en SARS-CoV-2 infektion i forhold til fremkomsten af symptomer. Link til figur

Kilder

Referencer

  1. Weissleder R, Lee H, Ko J, Pittet MJ. COVID-19 diagnostics in context. Sci Transl Med. 2020; 12.. Vis kilde
  2. Sethuraman N, Jeremiah SS, Ryo A. Interpreting Diagnostic Tests for SARS-CoV-2. JAMA. 2020.. Vis kilde
  3. He X, Lau EHY, Wu P, Deng X, Wang J, Hao X, Lau YC, Wong JY, Guan Y, Tan X, Mo X, Chen Y, Liao B, Chen W, Hu F, Zhang Q, Zhong M, Wu Y, Zhao L, Zhang F, Cowling BJ, Li F, Leung GM. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med. 2020; 26.; 672-675. Vis kilde
  4. Li R, Pei S, Chen B, Song Y, Zhang T, Yang W, Shaman J. Substantial undocumented infection facilitates the rapid dissemination of novel coronavirus (SARS-CoV-2). Science. 2020; 368.; 489-493. Vis kilde
  5. Lippi G, Mattiuzzi C, Bovo C, Plebani M. Current laboratory diagnostics of coronavirus disease 2019 (COVID-19). Acta Biomed. 2020; 91.; 137-145. Vis kilde

Fagmedarbejdere

Lennart Friis-Hansen

overlæge, dr. med., Klinisk Biokemisk Afdeling, Bispebjerg og Frederiksberg Hospital

Jette Kolding Kristensen

praktiserende læge, professor, ph.d., Center for Almen Medicin ved Aalborg Universitet

Har du en kommentar til artiklen?

Bemærk venligst, at du IKKE vil modtage svar på henvendelser, der omhandler din egen sygdom, pårørendes sygdom, blodprøvesvar, hjælp til at udarbejde skoleopgaver og litteratursøgning.

Indhold leveret af

Lægehåndbogen

Lægehåndbogen

Kristianiagade 12

2100 København Ø

Disclaimer: Lægehåndbogen